Etude du polymorphisme génomique chez les bactériophages T-pair

Study of genomic polymorphism in the t-even bacteriophages

• Auteur / Autrice : Francis Repoila
• Direction : Henry Krisch
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance en 1995
• Etablissement(s) : Toulouse 3

Mots clés

Mots clés contrôlés

Bactériophages

Génome

Polymorphisme génétique

Résumé

Les phages t-pair partagent des caracteristiques morphologiques et serologiques. Nous avons defini des criteres genetiques qui attestent de liens phylogenetiques et avons initie l'etude des variations de sequences de six regions genomiques. Deux types de polymorphisme ont ete identifies. Quatre de ces regions se distinguent par la presence ou l'absence de cadres de lecture ouverts. Les deux autres loci, dits ip, varient par le nombre et la nature des genes (ip) presents. Nous avons decouvert l'existence de dix genes ip differents qui codent pour des proteines (ips) contenues dans les virions. Chaque cadre de lecture ip est flanque d'une sequence d'environ 70bp repetees directement. Ces sequences intergeniques pourraient etre impliquees dans le polymorphisme observe. D'apres les observations concernant ip1, nous pensons que les ips determineraient, en partie, l'etendue du spectre d'hotes. Nous avons egalement recherche des elements genetiques capables de modifier au travers de leur variation, l'etendue du spectre d'hotes des phages t-pair. Nos etudes ont concerne le gene 31 (g31) et le gene 37 (g37). G31 code pour gp31, proteine essentielle qui interagit avec la proteine bacterienne groel. Nous avons montre que gp31 est extremement conservee chez les t-pair. Cette conservation pourrait refleter une contrainte selective vers un consensus fonctionnel optimal face a une diversite du partenaire groel. G37 est responsable de la specificite d'adsorption du phage t4 a la surface de la bacterie. Habituellement t4 se multiplie sur e. Coli et shigella, nous avons selectionne des virions qui infectent yersinia. L'analyse de ces phages a montre qu'il devait exister un mecanisme generateur d'une diversite de la portion des fibres impliquee dans la reconnaissance specifique de la bacterie par le phage