Approches statistiques pour l'analyse des trajectoires de dynamiques moleculaires. Applications a des molecules de la chimie supramoleculaire en phase gazeuse et en solution

par RICHARD COQUET

Thèse de doctorat en Physique

Sous la direction de G. WIPFF.

Soutenue en 1995

à Strasbourg 1 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Nous avons developpe differentes approches permettant d'analyser tant l'aspect geometrique que temporel des mouvements moleculaires obtenus par simulations de dynamique moleculaire. L'application a des systemes moleculaires nous a permis de definir un protocole d'analyse en phase gazeuse ou en solution. Apres correction des mouvements de translation et rotation globales de la molecule, l'analyse factorielle (avec rotation des facteurs) du tableau des coordonnees atomiques montre les differents mouvements internes (les facteurs principaux contiennent les directions de deplacements des atomes ; les composantes principales contiennent l'evolution temporelle des mouvements). Le filtrage multivarie permet de reconstruire des trajectoires moleculaires a partir de certains mouvements et ceci sans faire d'hypothese a priori quant a leur nature, contrairement au filtrage en frequences. Si la molecule est trop flexible, la correction des mouvements de translation et rotation globales risque d'etre mauvaise. L'utilisation de la methode statis est alors preferable. La classification a partir des composantes principales des structures observees dans une dynamique permet de la resumer en l'echange de quelques structures typiques. L'etude de la mobilite des protons par le calcul de temps de relaxation fournit des resultats proches de ceux de rmn en valeurs relative. Les mouvements peuvent apparaitre non-stationnaires et necessiter l'emploi de techniques specifiques, telle l'analyse temps-frequences. Sinon, fonctions d'autocorrelation, analyse spectrale et temps de relaxation sont suffisants pour caracteriser l'evolution temporelle des mouvements

  • Titre traduit

    Statistical approaches for analysis of molecular dynamics trajectories. Applications to supramolecular molecules in gas phase and in solution


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Informations

  • Détails : 320 P.
  • Annexes : 170 REF.

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  • Bibliothèque : Université de Strasbourg. Service des bibliothèques. Bibliothèque L'Alinéa.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : Th.Strbg.Sc.1995;2148
  • Bibliothèque : Université de Strasbourg. Service des bibliothèques. Bibliothèque L'Alinéa.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : H 503.000,1995
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