Etude des interactions proteine-glucide par modelisation moleculaire et resonance magnetique nucleaire

par FLORENCE CASSET

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Serge Pérez.

Soutenue en 1995

à Nantes .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Les interactions proteine-glucide sont impliquees dans de nombreux phenomenes biologiques dont la reconnaissance intercellulaire. Recemment un interet croissant s'est porte sur ces phenomenes d'interaction et de nouvelles methodes d'etude se sont developpees. Ce travail est notre contribution a la comprehension de plusieurs phenomenes d'interaction proteine-glucide. Des methodes de modelisation moleculaire, de resonance magnetique nucleaire et de cristallographie ont permis de decrire l'interaction de deux lectines de legumineuse et d'une enzyme avec leurs ligands glucidiques. Le site de reconnaissance de la lectine de lentille a ete decrit en interaction avec le mannose substitue et avec le saccharose. L'etude conformationnelle du saccharose dans ce site a ete realisee en tenant compte de la flexibilite conformationnelle des chaines laterales des acides amines. Cette etude a revele que malgre l'immobilisation du residu glucose dans le fond du site, le residu fructose pouvait adopter plusieurs positions autour de la liaison glycosidique. Les donnees rmn et cristallographique ont predit l'existence de conformations correspondant a celles de plus basse energie. Afin d'etudier les interactions lectine-galnac, la structure tridimensionnelle de la lectine de dolichos biflorus a ete construite par homologie de structure. Son site de reconnaissance a ete decrit en interaction avec le galnac, le trisaccharide de groupe sanguin a et le disaccharide de l'antigene de forssman. Les donnees de modelisation moleculaire ont ete validees par la mesure noes transferes. C'est la premiere fois qu'une interaction lectine-galnac est decrite precisement et l'importance des contacts hydrophobes entre le groupement n-acetyl de monosaccharide et les acides amines du site ont ete soulignes. Enfin, l'interaction de l'alpha-amylase pancreatique de porc avec differents substrats amylosiques a pu etre etudiee grace a la resolution d'un complexe cristallin de cette enzyme avec un inhibiteur


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Informations

  • Détails : 230 P.
  • Annexes : 200 REF.

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  • Bibliothèque : Université de Nantes. Service commun de la documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 95 NANT 2058
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  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 95 NANT 2058
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