Méthodes de prédiction des aptitudes de croissance des populations de micro-organismes

par Marie-Laure Delignette-Muller

Thèse de doctorat en Sciences. Biométrie

Sous la direction de Alain Pavé.

Soutenue en 1995

à Lyon 1 .

Le jury était composé de Alain Pavé.

mots clés

• Microorganismes -- Croissance -- Prévision
• Analyse de régression
• Antibiogramme

Résumé

La prediction des aptitudes de croissance des micro-organismes en vue d'une prise de decision est un probleme couramment rencontre tant en microbiologie medicale qu'en microbiologie alimentaire. Cette prise de decision, souvent associee a un risque important, est en general soumise a des contraintes temporelles et economiques. Il est alors necessaire de developper des methodes de prediction permettant de donner rapidement et avec un moindre cout une reponse la plus fiable possible. Dans la premiere partie, nous nous interessons a la prediction des aptitudes de croissance d'un micro-organisme pathogene en presence d'antibiotique. Apres avoir retrace l'evolution de la methode classique d'antibiogramme par diffusion et souleve les problemes lies a son utilisation, nous proposons une alternative plus fiable de la methode, basee sur l'etude theorique du phenomene de diffusion de l'antibiotique. Cette methode est testee sur des donnees experimentales, et des applications pratiques sont proposees. La deuxieme partie traite de la prediction de la cinetique de croissance d'une population de micro-organismes a partir de ses premiers points experimentaux. Les methodes classiques de modelisation ne permettent toujours pas de repondre a cette problematique. Deux methodes alternatives sont proposees et comparees aux methodes classiques sur des donnees experimentales. Il s'agit d'une part d'une approche populationnelle basee sur la technique d'inference bayesienne, et d'autre part de l'utilisation de reseaux de neurones artificiels

Titre traduit

Prediction methods of growth abilities of populations of microorganisms

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