Marqueurs hypervariables chez le loup (Dicentrarchus labrax L) : applications aux programmes d'amélioration génétique et à l'étude de populations naturelles

Hypervariable markers in the sea bass (Dicentrachus labrax L. ): applications in breeding programmes and in the study of natural populations

• Auteur / Autrice : Francisco Javier Garcia de Leon
• Direction : François Bonhomme
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Océanologie
• Date : Soutenance en 1995
• Etablissement(s) : Aix-Marseille 2
• Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université d'Aix-Marseille II. Faculté des sciences (1969-2011)

Résumé

La presente etude a permis de mettre au point l'analyse genotypique de d. Labrax pour 7 locus d'adn microsatellites a fort polymorphisme. Le mode de transmission mendelien de ces locus et la specificite des amorces d'amplification ont ete verifies. Une estimation de l'ordre de grandeur du taux de mutation a ete realisee sur 786 descendances des croisements controles, permettant de proposer une borne superieure de 2. 10#-#3. Le polymorphisme de ces marqueurs a ete utilise pour analyser trois aspects de la biologie appliquee et fondamentale de l'espece. Dans un premier temps, nous avons teste la faisabilite de l'utilisation des locus microsatellites dans les programmes d'amelioration genetique en aquiculture. Les resultats indiquent que l'identification de la descendance de plusieurs geniteurs eleves dans les memes bassins peut desormais etre envisagee grace a l'utilisation de ces marqueurs hypervariables et donner une puissance nouvelle a l'estimation des parametres de la genetique quantitative. Dans un deuxieme temps, nous avons etudie la possibilite d'identifier grace a ces marqueurs des stocks naturels dans des aires geographiques restreintes. Nous avons pu ainsi detecter une differenciation genetique entre populations separees par de courtes distances geographiques. Finalement, nous avons analyse la distribution de la diversite genetique et les relations phylogenetiques au sein de l'espece. A l'interieur du bassin ouest de la mediterranee, nous proposons qu'a l'echelle d'une ou deux generations il peut se produire des differenciations genetiques locales, mais probablement instables, en fonction de l'histoire particuliere subie par les cohortes echantillonnees. Un resultat tres significatif est que les populations de loup montrent une differenciation geographique dans le sens ouest-est de la mediterranee. Cette nouvelle generation de marqueurs a permis un eclairage approfondi des questions posees dans chacun de ces domaines