Realisation d'outils logiciels pour la biologie structurale application a la resolution de structures par resonance magnetique nucleaire bidimensionnelle

par ANNE-GAEL INISAN

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de H. DARBON.

Soutenue en 1994

à Paris 11 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    La cristallographie aux rayons-x et la resonance magnetique nucleaire multidimensionnelle sont deux methodes de resolution de structures tridimensionnelles de macromolecules biologiques. Toutes deux ne se concoivent plus desormais sans l'aide de l'informatique, notamment une aide logicielle. C'est ainsi que cette these a fait l'objet de developpements de logiciels d'aide a la resolution de structures tridimensionnelles. En premiere partie, le developpement d'une interface 'petites molecules' dans un logiciel de modelisation moleculaire deja existant: turbo-frodo, est presente. Cette interface a ete developpee dans le but de donner aux cristallographes la possibilite d'etudier des complexes macromolecules-ligand dans la carte de densite electronique. Elle comporte deux parties: une passerelle entre turbo-frodo et une banque de donnees de petites molecules: la cambridge structural database ; et un constructeur geometrique de petites molecules. La seconde partie concerne le developpement d'un logiciel d'attribution de spectres bidimensionnels de rmn: turbo-nmr. Ce logiciel, entierement graphique, permet l'interpretation des spectres, en proposant la visualisation des spectres, une tenue de notes interactive et des routines semi-automatiques d'attribution. Enfin, ce logiciel a ete utilise pour resoudre la structure d'un analogue d'une neurotoxine de scorpion (31 acides amines) ; puis, pour attribuer les spectres du domaine hemique du flavocytochrome b#2 de levure (99 acides amines)


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Informations

  • Détails : 158 P.
  • Annexes : 119 REF.

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  • Accessible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH2014-011980
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