Etude conformationnelle d'oligopeptides porteurs de la sequence consensus rxvrg, site d'action d'une endoprotease de la peau de xenopus laevis

par FRANCOIS-REGIS CHALAOUX

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de D. BARON.

Soutenue en 1994

à Paris 6 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Le but de l'etude presentee dans ce document est de montrer l'apport de la determination de la structure tridimensionnelle en solution d'une serie d'oligopeptides lineaires contenant la sequence consensus rxvrg a la comprehension de leur maturation par l'endoprotease-rxvrg de la peau de xenopus laevis. En effet, les proteases impliquees dans les processus de maturation des precurseurs et porteurs de ces oligopeptides necessitent un site de coupure tres specifique. Cette specificite doit etre necessairement associee a l'existence de caracteristiques sequentielles et/ou conformationnelles permettant la reconnaissance entre l'endoprotease et son substrat. L'etude conformationnelle a ete realisee par #1h-rmn (incluant les spectres cosy, hohaha et noesy) sur un tetradecapeptide, mimant l'environnement du site de reconnaissance, ainsi que sur des derives substitues ou fragmentes afin de preciser le role des acides amines sur cette activite enzymatique et sur la structuration de la zone consensus. L'existence de structures repliees au niveau de la zone consensus du tetradecapeptide modele est mise en evidence par: (a) les valeurs negatives permises pour les angles dihedraux (autour de -20) de val#7 et arg#8 ; (b) l'existence de liaisons hydrogenes (ou du moins de protection du nh vis-a-vis du solvant) pour les residus 6, 7 et 8 ; (c) la presence des correlations n#7n#8 et n#8n#9 ; (d) l'observation des interactions a moyenne distance: arg#5hval#7nh et asp#6harg#8nh ; (e) le ralentissement des temps de correlation des residus de la sequence consensus ; (f) la modelisation moleculaire qui montre egalement une organisation structurales au niveau de la sequence consensus en utilisant les contraintes issues de l'etude rmn. Le remplacement du residu val#7 par un ser#7 dans la zone consensus rend le peptide moins sensible a la rxvrg-endoprotease et favorise l'action d'une autre metalloendoprotease (phie). Les resultats rmn sont en accord avec une structure etendue pour ce peptide. Le remplacement du residu ser#1#2 par un ala#1#2, en dehors de la sequence consensus, entraine une diminution de l'affinite de l'enzyme pour le substrat. La modelisation moleculaire de ce peptide montre la possibilite d'interpreter l'ensemble des donnees rmn avec une seule structure plus etendue que le tetradecapeptide modele au niveau de la sequence consensus. L'activite de la rxvrg endoprotease (coupure 8-9) est reduite de moitie avec le peptide (ala#1#2), tandis que l'organisation structurale est manifestement moins importante que dans le tetradecapeptide modele

  • Titre traduit

    Conformational study of oligopeptides with the rxvrg consensus sequence, target of a xenopus laevis skin endoprotease


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Informations

  • Détails : 212 P.
  • Annexes : 131 REF.

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  • Accessible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1994
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