Analyse conformationnelle de peptides. Etude de relations structure/activite

par SONJA MEDDEB

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de P. VIGNY.

Soutenue en 1994

à Paris 6 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Cette these porte sur la determination de la structure tridimensionnelle de peptides a l'aide de donnees rmn dans le but de determiner des relations structure/activite. Deux etudes sont presentees. La premiere concerne des peptides de sequence krds et derives. Isole a partir de la lactotransferrine humaine, le peptide de sequence krds a une activite antithrombotique. Une etude rmn a ete realisee sur ce peptide qui est stable et structure dans l'eau. Les donnees rmn etant insuffisantes pour determiner la structure, nous avons procede a une exploration systematique de l'espace conformationnelle par recuit simule sans introduire de contraintes rmn. Un ensemble de structures a ainsi ete genere. Les resultats obtenus corroborent les resultats obtenus en rmn. Un travail d'analyse a permis de grouper ces structures en differentes classes sur la base de la matrice d'interaction electrostatique associee a chaque structure. Des etudes similaires ont ete realisees sur des peptides derives. La comparaison des classes obtenues pour ces differents peptides a conduit a emettre l'hypothese d'une relation structure/activite. La seconde etude porte sur des peptides possedant une activite antibacterienne, secretes dans la peau de l'amphibien xenopus laevis. La comparaison des peptides precurseurs a conduit a la synthese d'un tetradecapeptide comportant la sequence consensus rxvrg hautement conservee. Ce peptide a servi de substrat pour isoler une enzyme de maturation post traductionnelle denommee rxvrg-endoprotease qui coupe entre l'arginine et la glycine. Nous avons realise une exploration de l'espace conformationnel par recuit simule, en introduisant des contraintes rmn, sur ce tetradecapeptide modele ainsi que sur deux derives. Une incompatibilite de certaines donnees rmn a conduit a la determination de deux modeles pour le tetradecapeptide. De meme pour l'undecapeptide correspondant aux residus 4-14 du tetradecapeptide. Une hypothese de relation structure/activite est emise. (les logiciel charmm et xplor ont ete utilises)


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Informations

  • Détails : 203 P.
  • Annexes : 133 REF.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Accessible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1994
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