Structure par rmn et modelisation moleculaire d'oligonucleotides contenant soit une paire de bases non complementaires soit une thymine endommagee par des rayonnements ionisants

par Virginie Gervais

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de P. VIGNY.

Soutenue en 1994

à Paris 6 .

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  • Résumé

    Le but de cette etude est de determiner la structure tridimensionnelle d'oligonucleotides contenant des endommagements afin de comprendre les mecanismes structuraux qui regissent la reconnaissance et la reparation de differentes lesions dans l'adn. Dans un premier temps, nous nous sommes interesses aux consequences structurales d'un produit de radiolyse de la thymine: l'uree desoxyribose, qui a perdu une grande partie de l'information codante initiale. Une telle lesion introduite dans l'adn peut entrainer un blocage de l'adn ou etre a l'origine de mutations. Une premiere etude rmn de l'uree oppose a une thymine a mis en evidence la presence des deux isomeres trans et cis de l'uree. Une seconde etude structurale d'un residu d'uree non apparie dans l'adn a permis de confirmer que les deux isomeres trans et cis de l'uree sont presents en solution. L'uree non apparie adopte preferentiellement une position extrahelicale lorsqu'il est sous forme trans. L'etude des mecanismes de reconnaissance et de reparation des paires de bases non watson-crick dans l'adn reste un enjeu fondamental pour mieux comprendre dans quelle mesure un mesappariement aboutit a une mutation, pouvant etre a l'origine de tumeurs. Dans cette optique, nous avons etudie par rmn et dynamique moleculaire deux mesappariements a. A et t. T inseres a la position centrale de la sequence 29-39 du proto-oncogene k-ras. Cette etude a montre que les paires de bases a. A et t. T sont appariees selon une structure wobble qui n'entraine pas de deformation importante de la double helice d'adn. Pour chaque appariement wobble, deux conformations co-existent, la deuxieme conformation etant generee par rotation de 180 de la premiere conformation autour de l'axe pseudodyadique. Les etudes de dynamique moleculaire entreprises sur les deux oligonucleotides contenant chacun un mesappariement ont permis de suivre et de caracteriser le passage d'une conformation a l'autre


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Informations

  • Détails : 176 P.
  • Annexes : 300 REF.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : T Paris 6 1994 370
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1994
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