Modélisation de complexes du cuivre (I) et (II) : contribution à la prévision de leurs structures par mécanique et dynamique moléculaires

par Leila Benmenni

Thèse de doctorat en Chimie organique. Cristallographie

Sous la direction de Marcel Pierrot.

Soutenue en 1994

à Aix-Marseille 3 .


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  • Résumé

    Le travail presente dans ce memoire concerne l'etude de complexes de cuivre modeles de la dopamine beta hydroxylase, une cuproenzyme liee a la biosynthese des catecholamines. Une etude cristallographique a permis d'etablir la conformation de 3 ligands batis autour d'un groupement biphenyle et la structure du compose cu#2(c#1#7n#3h#2#1)2,#4[c1o]#4,3h#20 forme de deux entites distinctes, dans lesquelles l'atome de cuivre est pentacoordine suivant une bipyramide trigonale: la liaison courte (2. 01Å) cu-h#20 dans un complexe est remplacee, dans l'autre, par une liaison longue (2. 98Å) avec une atome d'oxygene d'un contre-ion perchlorate. Deux chapitres sont consacres a la modelisation moleculaire de complexes de cuivre (i) et (ii) et evaluent dans quelle mesure il est possible de prevoir leurs conformations. Un premier calcul, effectue avec le champ de force mm2, etablit une liste de parametres permettant le calcul et la minimisation de l'energie potentielle de complexes du cuivre (ii). Les modeles ainsi obtenus sont en bon accord avec les donnees experimentales. Un nouveau protocole de modelisation de ces complexes est ensuite propose pour le champ de force gromos. Il est fonde uniquement sur les interactions de van der waals et electrostatiques entre l'ion cu(i) ou cu(ii) et le ligand, et comporte d'une maniere generale les etapes suivantes: batir un modele non contraint du ligand autour de l'ion central libre ; attribuer des charges electrostatiques (par un calcul eht par exemple) ; minimiser le complexe solvate par mecanique ou dynamique moleculaire. De nombreux exemples mettent en evidence les limites et les avantages de cette methodologie, qui constitue une contribution a la modelisation des composes organo-metalliques

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Informations

  • Détails : 101 p.

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  • Bibliothèque : Université d'Aix-Marseille (Marseille. Saint-Jérôme). Service commun de la documentation. Bibliothèque de sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : T 2156/A-B
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