Obtention et analyse des rna synthetiques correspondant au genome du virus du court-noue de la vigne (gflv). Contribution a l'etude de l'organisation genomique du virus

Production and analysis of synthetic rnas corresponding to the genomic rnas of grapevine fanleaf virus. Contribution to the study of viral genome organization

• Auteur / Autrice : MARTINE MOUSSAID VIRY
• Direction : LOTHAIRE PINCK
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées
• Date : Soutenance en 1993
• Etablissement(s) : Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)

Résumé

Le virus du court-noue de la vigne ou grapevine fanleaf virus (gflv) est un nepovirus. Il comporte deux rna genomiques (rna1 et 2) de polarite positive, polyadenyles en 3 et lies a une proteine vpg en 5; le rna1 contient 7342 nucleotides avec une sequence 5 non codante de 242 nucleotides et 3 non codante de 241 nucleotides. La phase ouverte code pour une polyproteine de mr=253k (p1). Des comparaisons de sequence du rna1 du gflv avec celle du rna-b du cpmv ou celles du rna1 du tbrv ou du gcmv, ont permis de preciser le niveau de parente entre ces virus. Des transcrits synthetiques correspondant aux rna genomiques du gflv, possedant une structure cap et un g extraviral en 5 ont ete obtenus et sont infectieux. Le rna2 est incapable de se repliquer en absence du rna1, mais il est indispensable pour que la virose s'installe dans la plante (c. Quinoa). Toutefois, les symptomes observes sont plus faibles qu'avec la souche naturelle. L'analyse des rna viraux extraits des plantes infectees par les transcrits montre que le nucleotide extraviral n'est pas retenu dans la descendance et que les rna sont lies a la vpg. Le rna1 contient l'information pour la proteinase virale qui a ete clonee et est active sous sa forme libre et sous forme de precurseur dans le lysat de reticulocytes de lapin. Elle a ete utilisee pour des etudes de maturation de la moitie n-terminale de la polyproteine p1. Elle permet la liberation d'une proteine n-terminale de mr=45k(p45). L'action differentielle de la proteinase et de son precurseur vpg-proteinase a ete montree au niveau du site de clivage presume c/a permettant la liberation de la proteine p45