Etude de l'impact de l'échantillonnage des espèces et de la longueur des séquences sur la robustesse des phologénies moléculaires : implications sur la phylogénie des téleosteens

par Guillaume Lecointre

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de André Adoutte.

Soutenue en 1993

à Paris 7 .

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  • Résumé

    La phylogénie des poissons est étudiée à partir des séquences de leur arn ribosomique 28s. La richesse taxinomique de l'échantillon a permis d'étudier précisément l'ampleur et la répartition des variations de la robustesse (valeurs de bootsrap) causées par le changement ou l'ajout d'espèces dans un arbre. Les arbres à 4 espèces ne sont pas fiables car ils présentent des parentés contradictoires robustes en fonction des espèces choisies pour représenter les mêmes taxa. L'échantillonnage exhaustif d'une espèce par groupe pré-defini montre l'impact de chaque espèce sur la robustesse de chaque nud; et etablit que l'impact de l'échantillonnage d'un groupe donne est très localisé dans l'arbre. Une étude de la qualité et de la répartition de l'homoplasie dans les séquences montre que l'homoplasie effective est, pour un site donné, régionalisée dans l'arbre et que ceci peut expliquer le caractère local de l'impact de l'échantillonnage des espèces. L'étude de l'évolution de la robustesse de chaque nud en fonction de la longueur des séquences a permis la création d'un outil d'inférence du nombre de sites informatifs requis pour la résolution d'un nud donné. Les séquences d'arnr 28s montrent que chondrichthyens, sarcopterygiens et actinopterygiens sont apparus en un temps très court il y a 420 millions d'années. Les élopomorphes sont peut-être le groupe-frère des osteoglossomorphes, mais cette parenté n'est pas attestée par les données morpho-anatomiques. Ostariophyses et clupeomorphes sont groupe-frères, car en plus des séquences, des caractères morpho-anatomiques convaincants plaident pour un tel regroupement tandis que ceux qui le contredisent ne sont pas fiables. Le clade des euteleosteens demande a être redéfini


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Informations

  • Détails : 1 vol. (442 p.)
  • Annexes : 335 REF.

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  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • Accessible pour le PEB
  • Cote : TS1993
  • Bibliothèque : Muséum national d'histoire naturelle. Bibliothèque centrale.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 123 758
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