Conformation et activite catalytique des ribozymes en epingle a cheveux

par DJALMA VITORINO DOS SANTOS

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Daniel Blangy.

Soutenue en 1993

à Paris 6 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    L'objet de notre travail est d'etudier des interactions ribozyme-substrat dans le domaine catalytique du ()strsv et l'activite dans des systemes modifies a partir de ce domaine. Afin d'etudier les interactions, nous avons utilise des analogues deoxyribonucleotides du substrat dotes des sondes de photoaffinite intrinseque (la deoxy-4-thiouridine et la deoxy-6-thioinosine), en positions specifiques. Cette methode originale permet la mise a jour d'une serie de contacts entre le ribozyme et son analogue substrat. La deoxy-4-thiouridine a ete utilisee dans un systeme natif et dans un autre systeme qui possede le ribozyme modifie pour cliver specifiquement une sequence conservee de la region ltr de l'arn du vih (ribozyme en l, anti-vih). Tous les analogues testes ont forme un ou plusieurs ponts avec le ribozyme. La plupart des ponts identifies dans les systemes analyses fournissent des evidences additionnelles qui confirment la structure bidimensionnelle proposee par hampel et coll. (1990). Dans le systeme natif, en particulier, nous avons mis en evidence d'autrs zones d'interactions, moins intenses, qui suggerent des conformations alternatives. La deoxy-6-thioinosine a ete utilisee pour analyser les deux positions qui entourent le site de clivage (g#+#1 et a##1). Tous les ponts identifies se trouvent au niveau de la boucle entre les helices i et ii, ou se situe le site de clivage. Ces resultats mettent en evidence une grande flexibilite de cette region et de l'importance de cette boucle dans l'activite du ribozyme en l. L'activite catalytique a ete analysee dans le domaine natif et dans le complexe ribozyme en l anti-vih-substrat, mentionne ci-dessus, les deux dotes des paires gu a la place de paires au. Dans le premier cas nous avons constate que le systeme presente une importante activite. En ce qui concerne le ribozyme en l anti-vih, nous avons constate qu'il est beaucoup moins actif que son analogue sauvage


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Informations

  • Détails : 94 P.
  • Annexes : 142 REF.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Accessible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1993
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