Contribution a la modelisation de la reactivite dans les macromolecules biologiques

par VINCENT THERY

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Jean-Louis Rivail.

Soutenue en 1993

à Nancy 1 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Cette these presente une nouvelle methodologie mixte quantique/classique, dans le but d'etudier un processus chimique dans une macromolecule biologique. La methode lscf (local self consistent field), a ete developpe afin de traiter un sous-systeme (site actif d'une proteine) a l'aide des methodes de la chimie quantique, alors que le reste de la macromolecule est traite de facon classique. L'idee novatrice de cette methode, est de ne pas isoler chimiquement le sous-systeme quantique du sous-systeme classique, afin de conserver une certaine continuite de la chaine polypeptidique en vue d'appliquer ulterieurement la mecanique moleculaire sur l'ensemble de la macromolecule. La methode lscf est ensuite testee sur un tetrapeptide gly-arg-glu-gly dans lequel le processus de transfert intramoleculaire de proton est etudie, puis sur une macromolecule biologique, la dihydrofolate reductase. Enfin le probleme de la variation de pka de l'histidine du lysosyme de phage t4 est aborde


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Informations

  • Détails : 120 P.
  • Annexes : 86 REF.

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  • Bibliothèque : Université de Lorraine (Villers-lès-Nancy, Meurthe-et-Moselle). Direction de la Documentation et de l'Edition - BU Sciences et Techniques.
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