Caractérisation et détection dans le sol des Agrobacterium du pommier

par Christine Picard

Thèse de doctorat en Sciences. Microbiologie

Sous la direction de René Bardin.

Soutenue en 1993

à Lyon 1 .

Le président du jury était René Bardin.


  • Résumé

    Le crown gall est une maladie des vegetaux particulierement genante en pepinieres. Une bonne prophylaxie peut etre obtenue par plantation de plants sains. Afin d'eviter la plantation en sol contamine, il est necessaire de s'assurer de l'absence d'agrobacterium pathogenes dans les sols. Dans le cas du pommier, les tumeurs de crown gall sont induites par des souches bien particulieres. Les agrobacterium isoles de crown gall de pommier sont bien pathogenes. Mais ils ont de nombreuses particularites par rapport aux souches d'agrobacterium pathogenes generalement decrites: 1) ils sont tres proches genetiquement l'un de l'autre; 2) ils ont une gamme d'hotes tres etroite; 3) ils induisent la synthese de traces de nopaline, mais ils sont incapables de cataboliser la nopaline; 4) les genes de pathogenie qui ont ete detectes dans ces souches presentent peu d'homologie avec ceux de souches a large gamme d'hotes. Cependant, les agrobacterium de pommier semblent se rapprocher des agrobacterium a nopaline: ils sont capables d'induire la synthese de nopaline, et ils renferment des sequences nucleotidiques homologues au gene nos. De plus, des sequences nucleotidiques du gene tmr et de l'intergene virb-virg sont totalement homologues a celles decrites chez les agrobacterium a nopaline. La methode de detection dans les sols des agrobacterium pathogenes est basee sur l'amplification enzymatique (pcr) avec les amorces specifiques situees dans l'intergene virb-virg. Chaque etape du protocole a ete developpee pour permettre de detecter le plus petit nombre possible de sequences cibles. Experimentalement le protocole permet de detecter une seule sequence cible. Ceci permet de detecter de 10#3 a 10#8 cellules par gramme de sol. Lors de son application en conditions agronomiques, la methode a permis d'estimer a 410#4 la population d'agrobacterium pathogenes d'un sol de pepiniere de pommier naturellement contamine


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Informations

  • Détails : 1 vol. (vii-123 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 105-123

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  • Bibliothèque : Université Claude Bernard (Villeurbanne, Rhône). Service commun de la documentation. BU Sciences.
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