Structure tridimensionnelle de la ferredoxine i de desulfovibrio africanus par cristallographie aux rayons x avec utilisation du signal anomal

par ANNE SERY

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de MICHEL ROTH.

Soutenue en 1993

à Grenoble 1 .

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  • Résumé

    Ce memoire est consacre a la determination de la structure d'une ferredoxine bacterienne par cristallographie aux rayons x avec utilisation du signal anomal. Il s'agit de la ferredoxine i de desulfovibrio africanus qui comporte 64 residus dont 5 cysteines et un agregat (4fe-4s). Les essais de resolution de la structure de cette ferredoxine par la methode de diffusion anomale multilongueur d'onde ont permis d'etudier les problemes methodologiques subsistant pour cette technique. Les positions des centroides des agregats fe-s ont ete determinees a l'aide de la methode de diffusion anomale a une longueur d'onde et la structure tridimensionnelle de la ferredoxine a ete resolue par la methode du remplacement moleculaire. L'information issue des phases calculees par la methode anomale a une longueur d'onde a partir des positions des atomes de fer a aide a corriger le modele initial. Le modele de la ferredoxine etudiee a ete affine avec des donnees completes a 2. 5 a ; le facteur r de desaccord calcule pour la tranche de resolution de 10 a 2. 3 a est de 18. 2 %. La structure tridimensionnelle de la ferredoxine i de d. Africanus est tres proche de celle des ferredoxines a un agregat fe-s deja resolues: la ferredoxine ii de d. Gigas et la ferredoxine de b. Thermoproteoliticus. Elle presente une caracteristique remarquable avec la presence d'un cinquieme atome de soufre cysteinique au voisinage de l'agregat fe-s. Une structure tres similaire est trouvee au voisinage du deuxieme agregat fe-s des ferredoxines de azotobacter vinelandii et de peptococcus aerogenes


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Informations

  • Détails : 223 P.
  • Annexes : 158

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