L'organisation du chromosome eucaryote et ses implications dans le contrôle de l'activité génique et la transmission des patrons d'expression : le modèle des gènes ribosomiques de Xenopux laevis

par Philippe Pasero

Thèse de doctorat en Biologie cellulaire et microbiologie

Sous la direction de Monique Marilley.

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  • Résumé

    Les differents niveaux d'organisation du genome eucaryote sont directement impliques dans le controle de l'expression et de la replication. Dans le but de mieux comprendre les relations structurales et fonctionnelles qui s'etablissent entre ces differents processus, nous avons mis en place les conditions d'etude permettant d'une part d'analyser le role de la structure du dna dans les repliements de la fibre de chromatine, et d'autre part d'isoler specifiquement un compartiment nucleaire fonctionnel, ce qui nous permet d'acceder a l'ensemble des niveaux d'organisation des chromosomes. La premiere partie de ce travail a necessite la mise au point de plusieurs programmes de modelisation de la structure locale et globale de la double helice. L'analyse theorique de plusieurs sars et origines de replication confirme l'organisation modulaire de ces sequences et permet de degager plusieurs caracteristiques constantes, comme par exemple la presence de motifs courbes ou d'un sillon mineur etroit. De plus, l'etude d'un dna satellite de x. Laevis a permis de mieux comprendre comment la structure locale du dna peut coder pour un repliement locus-specifique de la fibre de chromatine. Les genes ribosomiques de xenopus laevis et de saccharomyces cerevisiae ont ete choisis comme modele pour la seconde partie de cette etude. La digestion du genome par des endonucleases ne presentant pas de sites de coupure dans le rdna nous a permis d'isoler la totalite du cluster des genes ribosomiques chez ces organismes, aussi bien sous la forme de dna nu que de chromatine. Les applications de cette technique sont multiples. Chez s. Cerevisiae, nous avons pu mettre en evidence une relation de taille entre les replicons et les boucles de rdna. Chez le xenope, etant donne que la methode utilisee peut etre appliquee a n'importe quel type cellulaire, la dissection du cluster permet desormais d'aborder l'etude de la transmission des patrons d'expression genique selectionnes au cours du developpement


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Informations

  • Détails : 1 vol. (192 f.).
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. : f. 174-192

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  • Bibliothèque : Université Aix-Marseille (Marseille. Luminy). Service commun de la documentation. Bibliothèque de sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 22974
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