Etude théorique et modélisation du changement conformationnel d'une macromolécule biologique : la citrate synthase

par Mohammed Anass Ech-Cherif El-Kettani

Thèse de doctorat en Chimie des biomolécules

Sous la direction de Jean Durup.

Soutenue en 1992

à Toulouse 3 .


  • Résumé

    La plupart des macromolecules biologiques doivent leur activite a un changement conformationnel tres complexe. Au cours de cette etude nous avons developpe deux methodes capables de decrire theoriquement un changement conformationnel. Nous avons pris comme modele une enzyme du cycle de krebs, la citrate synthase, qui passe d'une forme ouverte a une forme fermee lors de la catalyse enzymatique. La premiere methode utilisee, appelee algorithme de chaine, a consiste a creer 15 conformations intermediaires entre les deux formes connues, par interpolation dans l'espace des coordonnees internes de vecteurs de jacobi. Une deuxieme methode entierement differente, que nous avons appelee dynamique dirigee a ete developpee et mise en uvre. Tous les calculs de minimisation et de dynamique ont ete effectues avec les programmes charmm. L'analyse de ces deux chemins, par l'etude de coordonnees angulaires ou par la methode p-curves, montre une grande similarite entre eux. Cette analyse met en evidence d'une part des mouvements sequentiels et d'autre part l'existence de mouvements transitoires de deverrouillage. Certains resultats issus de notre analyse peuvent suggerer des tests experimentaux, allant de la mutagenese dirigee au marquage selectif de certains residus


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Informations

  • Détails : [6]-139 f

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paul Sabatier. Bibliothèque universitaire de sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 1992TOU30101
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