Reconstruction et visualisation de surfaces et de volumes en microscopie electrnique a transmission et en microscopie confocale

par PHILIPPE GREMILLET

Thèse de doctorat en Physique

Sous la direction de Michel Jourlin.

Soutenue en 1992

à SAINT ETIENNE .

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  • Résumé

    Dans le premier chapitre est effectue un bref historique relatant les travaux preliminaires realises lors du dea, concernant la faisabilite d'une reconstruction 3d en microscopie electronique. Cette reconstruction implique la prise en compte des deformations geometriques dues a la decoupe, ainsi que des variations d'eclairement. Dans le deuxieme chapitre sont presentees les techniques mises en uvre afin de pouvoir corriger les deformations tant geometriques que d'eclairement. Les deformations geometriques sont gerees par un marquage externe a l'aide de tirs lasers prealablement a la decoupe. Les variations d'eclairement sont stabilisees a l'aide de l'outil lip (logarithmic image processing). Des techniques de visualisation en bloc de l'objet 3d reconstruit sont proposees. Le troisieme chapitre presente des techniques de saisie et de visualisation de surfaces en microscopie confocale. Plusieurs types de visualisation sont proposes. Le quatrieme chapitre traite du probleme de visualisation d'objets marques a l'aide d'une substance fluorescente, toujours en microscopie confocale. Une technique de visualisation de l'objet en semi-transparence est proposee, ainsi que la fusion de cette information avec des coupes opaques dans l'objet. Le dernier chapitre traite de la visualisation de l'enveloppe d'un objet, apres contournage manuel coupe apres coupe. Un algorithme de mise en correspondance des contours d'une coupe sur l'autre amenant une facettisation de l'enveloppe est presente. Une visualisation lissee de l'enveloppe est proposee, conjointement a celle de coupes quelconques traversant le bloc


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  • Annexes : 8 REF

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