Contribution a l'etude de la region 5' non-codante de l'arn du virus y de la pomme de terre

Preliminary studies on the 5' non-translated region of potato virus y rna

• Auteur / Autrice : CAROLINE LEVIS
• Direction : Michel Dron
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1992
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Le virus y de la pomme de terre (pvy) est le membre type du groupe des poty-virus. Mon travail s'est porte sur l'etude de la region 5' non-codante (5'- ntr) de l'arn du pvy qui comporte 184 nucleotides et qui possede une proteine (vpg) liee de facon covalente a son extremite 5'. Cette region a un role primordiale puisque lors de la traduction virale l'unique arn genomique synthetise une polyproteine qui est ensuite clivee par proteolyse. La 5' ntr de l'arn du pvy a ete placee en amont d'un gene rapporteur afin de mesurer l'efficacite de la traduction in vitro. L'utilisation de six oligonucleotides antisens correspondant a divers regions de la 5' ntr nous a permis d'identifier certaines sequences cibles pour l'initiation de la traduction de l'arn du pvy. En effet, l'oligonucleotide recouvrant les 16 premieres bases de l'arn genomique inhibe totalement la traduction. La 5' ntr de l'arn du pvy a egalement ete positionnee de facon interne soit par addition de bases en amont de cette region, soit en la placant dans la region intercistronique d'un transcrit bicistronique. L'analyse de ces constructions suggere que la traduction in vitro peut se realiser selon un mecanisme d'initiation interne. Un serum dirige contre un peptide synthetique correspondant a une region conservee chez les differents potyvirus et situee dans la region n-terminale de la protease a ete obtenu. Ce serum reagit egalement avec une proteine native, liee de facon covalente a l'arn du pvy. Cette proteine de 18 kda environ correspondrait au vpg