Structure et dynamique de fragments peptidiques : influence d'une interface micellaire. etude par resonance magnetique nucleaire

par François Macquaire

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de P. VIGNY.

Soutenue en 1992

à Paris 6 .

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  • Résumé

    L'objet general de ce travail est l'etude des processus de structuration induits par une interface membranaire sur la conformation de peptides. Des peptides et lipopeptides ont ete synthetises et leur conformation etudiee par resonance magnetique nucleaire (rmn) des protons, dans des solvants organiques ainsi qu'en solution aqueuse, en absence et en presence de micelles de dodecylphosphocholine deuterees. La premiere partie de ce travail est consacree a l'etude conformationnelle d'un peptide modele kgrkdg et du lipopeptide correspondant, obtenu par couplage avec un groupement lipidique par l'intermediaire de la chaine laterale de la lysine. En solution aqueuse, le peptide libre est essentiellement desordonne, y compris en presence de micelles. Ancre a l'interface membranaire, le peptide adopte une conformation preferentielle de type turn. Il nous a aussi ete possible de determiner la conformation precise du fragment diacyl-glycerique dans un environnement lipidique et etablir l'orientation moyenne du fragment peptidique par rapport a l'interface micellaire. La seconde partie de ce travail est consacree a l'etude conformationnelle de fragments peptidiques issues de l'annexine i. Les annexines sont une famille de proteines liant specifiquement les ions calcium et les phospholipides et dont la sequence primaire fortement symetrique, autorise une etude par fragments. La conformation de deux peptides de synthese f1(18aa) et f2(32aa), revelee par rmn, est tres proche de celle observee dans le cristal: boucle-helice pour f1 et helice-boucle-helice pour f2. En presence de micelles, la conformation preferentielle (helices et boucle) du fragment f2 est stabilisee et quelques elements de structures tertiaires (contacts entre helices) sont detectes. L'influence du calcium sur la conformation du fragment f2 consiste a structurer la boucle ce qui induit une stabilisation des deux helices, probablement due a l'augmentation des contacts entre helices


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Informations

  • Détails : 205 P.
  • Annexes : 190 REF.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Accessible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1992
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