Construction et utilisation d'une base de données de triplets pour la modélisation de triples hélices d'ADN

par Jean-Marc Piriou

Thèse de doctorat en Modélisation moléculaire

Sous la direction de Marc Lebret.


  • Résumé

    A partir des données expérimentales dont on dispose sur les triples hélices - diffraction de rayons X par des fibres de polynucléotides triple brin, et cristallographie de l’ARN de transfert -, nous avons déduit des principes et des règles grâce auxquels nous avons construit une base de données structurales de 64 triplets. Nous avons ainsi envisagé, pour les triplets ATT, GCC+ et GCG, toutes les combinaisons possibles pour ce qui concerne l'appariement de troisième brin, l'orientation de sa chaîne sucre-phosphate, et son anomérie - alpha ou beta. Nous avons ensuite utilisé cette base de données pour caractériser toutes les fonctions possibles entre ces triplets, et nous proposons un certain nombre de jonctions pouvant être réalisées entre segments contenant purines et pyrimidines sur le premier brin. Apres avoir étendu aux triples hélices la convention qui définit les paramètres hélicoïdaux des ADNs double brin, nous avons donné une description géométrique des triples hélices existantes, et propose des modèles pour quatre d'entre elles, sur la base d'une étude par mécanique et dynamique moléculaires.

  • Titre traduit

    Construction of a structural database of 64 triplets for the molecular modelling of DNA triple helices


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Informations

  • Détails : 1 vol. (126 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. 387 réf.

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  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : TH 54198
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