Contribution a l'etude des parametres structuraux necessaires a l'aminoacylation du trdna-like du rna du virus de la mosaique du brome et des trnatyr etq trnaasp de levure par les aminoacyl-trna synthetases

par Véronique Perret

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Richard Giegé.

Soutenue en 1990

à Strasbourg 1 .

mots clés

Résumé

Au cours de cette these, nous nous sommes interesses a une etape clef de la biosynthese proteique, l'aminoacylation des trna par les aminoacyl-trna synthetases. Notre etude a ete focalisee sur la determination des parametres structuraux des trna qui conduisent a leur aminoacylation specifique en presence de leur synthetase homologue. La specificite de la reaction d'aminoacylation est en effet une etape cruciale pour assurer la fidelite de la traduction de l'information genetique. Deux systemes d'aminoacylation particuliers ont ete etudies: le systeme specifique de la tyrosine et celui specifique de l'acide aspartique. Dans le cas du systeme specifique de la tyrosine, l'analyse a porte sur deux types de trna, l'extremite trna-like du rna du virus de la mosaique du brome et le trnatyr de levure, tous deux efficacement reconnus par la tyrosyl-trna synthetase de levure. L'etude de l'interaction de chacun de ces trna avec la tyrrs a permis d'etablir des analogies structurales entre l'extremite trna-like du virus de la mosaique du brome (de structure tres complexe) et le trnatyr. Ainsi par exemple, le bras du trna-like contenant le repliement en pseudo-nud a ete trouve analogue au bras accepteur du trnatyr, demontrant que la presence du pseudo-nud ne perturbe pas l'interaction avec la tyrrs. Une analogie a egalement ete trouvee entre un bras complexe du trna-like (contenant des sequences trouvees en amont de la sequence determinee comme minimale) et la branche anticodon/d du trnatyr. Cette etude a permis de suggerer que les determinants majeurs de la tyrosylation se trouvent probablement au niveau du bras accepteur. L'etude du systeme specifique de l'acide aspartique a fait appel a la technique de transcription in vitro. Cette technique permet d'obtenir des transcrits de trnaasp depourvus de bases modifiees et portant a volonte des modifications de sequences. L'analyse du transcrit de trnaasp d

Titre traduit

Contribution to the study of the structural parameters requieres for the aminoacylation of trna like of brome mosaic virus rna, yeast trnatyr and trnaasp by aminoacyl-trna synthetases

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