Realisation d'outils logiciels pour la cristallographie des macromolecules biologiques

par ALAIN ROUSSEL

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de JUAN FONTGLILLA.

Soutenue en 1990

à Paris 11 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    La cristallographie des macromolecules biologiques permet d'obtenir, a partir du spectre de diffraction aux rayons x de monocristaux, la structure tridimensionnelle de l'objet biologique. Elle comporte quatre etapes principales: la cristallogenese, l'enregistrement du spectre de diffraction, l'obtention des phases et la constrution du modele. Ce travail decrit la conception de logiciels pour les premiere et derniere etapes. Dans la premiere partie, nous avons ecrit un logiciel d'interrogation en langage naturel (anglais) d'une base de donnees de cristallisations de macromolecules biologiques. Nous avons fait un etude statistique sur l'utilisation des differents agents precipitants. Nous avons ensuite realise un programme d'analyse des contacts cristallins intermoleculaires. Nous avons compare ces interactions avec celles existant a l'etat naturel dans les multimeres proteiques. La deuxieme partie de ce travail a ete consacree a la realisation de logiciels de graphisme moleculaire. Nous avons tout d'abord ecrit une option permettant de representer, d'editer et de manipuler les molecules reliees par symetrie sur un ecran graphique. Puis nous avons realise, de novo, un logiciel complet de graphisme moleculaire: turbo-frodo. Ce logiciel est fonde sur une base de donnees arborescente. Il permet la modelisation et la construction de modeles de macromolecules dans des cartes de densite electronique. La facilite d'utilisation et la diversite des options font de ce logiciel un outil pour la cristallographie et aussi pour la biologie moleculaire structurale


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Informations

  • Annexes : 75 REF

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  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Orsay, Essonne). Service Commun de la Documentation. Section Sciences.
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  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH2014-010182
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