Prédiction de la structure des protéines par homologie : structures secondaires et modélisation de la structure tertiaire

par Jonathan Mark Levin

Thèse de doctorat en Sciences biologiques

Sous la direction de Jean Garnier.

Soutenue en 1989

à Paris 11 .


  • Résumé

    Ce travail présente de nouvelles méthodes pour extraire des informations structurales à partir d'une séquence en acides aminés et l'application de ces méthodes à la modélisation des protéines. Nous avons mis au point un algorithme d'alignement multiple pour des séquences protéiques basé sur l'algorithme de Needleman et Wunsch, mais qui n'est pas limité par le nombre et la taille des séquences protéiques à aligner. Nous avons développé une méthode de prédiction des structures secondaires, la Méthode des Homologues, basée sur les similarités entre peptides, qui prédit correctement 63% des résidus d'acides aminés, pour trois états. Cette méthode prédit correctement 87% des résidus d'une protéine homologue avec une protéine de la base de données. Nous avons utilisé un modèle simplifié de la chaîne polypeptique pour déterminer les limites des calculs par minimisation de l'énergie. Nous avons appliqué ces techniques à la modélisation des protéines de choc thermique (HSP90), du domaine liant l'ADN des protéines régulatrices FixK et Fnr et du domaine liant l'hème de la nitrate réductase de tabac.

  • Titre traduit

    Protein structure prediction by homology : secondary structure and tertiary structure modeling


  • Pas de résumé disponible.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe sous forme papier

Informations

  • Détails : 1 vol. (153 f.)cill. en noir et en coul.
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. f. 141-150

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Orsay, Essonne). Service Commun de la Documentation. Section Sciences.
  • Accessible pour le PEB
  • Cote : 0g ORSAY(1989)135
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH2014-035411
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.