Etude par rmn de la deformation d'un decanucleotide duplex platine : confrontation avec les resultats de la mecanique moleculaire

par FREDERIC HERMAN

Thèse de doctorat en Sciences médicales

Sous la direction de JEAN CLAUDE CHOTTARD.

Soutenue en 1989

à Paris 6 .

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  • Résumé

    Deux etudes structurales realisees par rmn, l'une sur le chelate forme par platination du dinucleotide d(gpc), l'autre sur le decanucleotide duplex d(gccg*g*atcgc)-d(g3atcgc)-d(gcgatccggc) contenant l'adduit gg-pt au niveau des deux guanines marquees d'un asterisque, sont exposees dans cette these. La premiere partie de notre etude permet de caracteriser la conformation des quatre isometres du chelate d(gpc)-pt obtenus apres coordination du cis-ddp sur les azotes n7 de la guanine et n3 de la cytosine. Leur analyse structurale montre que les isometres ganticsyn et gsyncsyn ont une structure compatible avec leur presence dans les doubles-helices d'adn b et z respectivement. L'absence du chelate d(gpc)-pt dans l'adn platine est discute. La seconde partie de l'etude comporte l'analyse par rmn#1h et #3#1p de la perturbation d'une double-helice de decanucleotides qui contient le chelate d(gpc)-pt forme majoritairement au cours de la platination de l'adn. Cette etude met en evidence (i) la conservation de l'appariement des deux brins et (ii) la localisation de la deformation provoquee par la coordination du platine au niveau des deux paires g:c du chelate ainsi que sa repercution du cote 5 du chelate sans affecter la structure de l'helice du cote 3. Les donnees de la rmn (variations de deplacement chimique, conformation des sucres, distances interproton) ne permettant pas de decrire la structure du duplex, celles-ci sont confrontees avec les modeles calcules par la mecanique moleculaire. Cette confrontation montre qu'un equilibre conformationnel entre trois des differents modeles coudes calcules est compatible avec l'ensembre des donnees de la rmn


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Informations

  • Annexes : 12 REF

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Accessible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1989
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