Étude d'un coronavirus, le virus de la gastro-entérite transmissible du porc : identification des gènes structuraux et non-structuraux et localisation d'un site antigénique majeur sur la séquence de la glycoprotéine de spicule E2

par Denis Rasschaert

Thèse de doctorat en Sciences biologiques

Sous la direction de Bernard Laude.

Soutenue en 1988

à Paris 11 , en partenariat avec Université de Paris-Sud. Faculté des Sciences d'Orsay (Essonne) (autre partenaire) .


  • Résumé

    Le virus de la Gastro-entérite du porc appartient à la famille des Coronaviridae, un groupe de virus enveloppés dont le génome est constitué d'un long ARN de polarité positive. La séquence des 8300 nucléotides en région 3' de l'ARN génomique du VGET (souche Purdue-115) a été établie à partir de clones d'ADNc. Par rapport au génome entier (> 20 kb) cela recouvre l'ensemble des séquences exprimées par l'intermédiaire des 6 ARNs subgénomiques détectés dans les cellules infectées. Ces ARNs forment, avec l'ARNg, des séquences emboîtées coterminales en 3', caractéristiques du mode de réplication des coronavirus. Une séquence hexamérique 5'CUAAAC3', présente juste en amont de chaque région codante, constituerait le site d'initiation de la transcription des ARNs du VGET. Outre les gènes des 3 protéines structurales E2, E1 et N, correspondant à la région unique des ARNm 2, 5 et 6, 4 autres cadres de lecture X1, X2a et X2b, et X3 (ARN3, 4 et 7) sont identifiés. Ces 4 cadres de lecture pourraient coder pour 4 polypeptides non structuraux, non encore détectés dans les cellules infectées. Le produit du gène N (PM = 43,5K) est fortement basique et riche en résidus sérine, sites potentiels de phosphorylation. Le gène E1 dirige la synthèse d'un polypeptide de PM = 27,7K, qui après excision du peptide signal, resterait essentiellement enfoui dans la membrane virale. L'analyse du produit du gène E2 (158K) fait apparaître : a) une séquence signal absente de la protéine mature. B) 32 sites potentiels de N­ glycosylation. C) une région d'ancrage, très hydrophobe, près de l'extrémité COOH. D) une hélice amphipatique pouvant correspondre à la tige des spicules. Un rôle fonctionnel pour chaque séquence peptidique conservée entre les différents coronavirus est proposé. Des fragments couvrant la majeure partie du gène E2 ont été exprimés dans E. Coli sous la forme de protéines hybrides cro-bêta-galactosidase, ce qui a permis la localisation du site C (l'un des 4 sites antigèniques majeurs identifiés sur la protéine E2 à l'aide d'Ac. Mo. ) entre les résidus 362 et 512.

  • Titre traduit

    Study of a coronavirus, the Transmissible Gastroenteritis Virus : identification of structural and non-structural genes and localization of one major antigenic site on the sequence of the spike glycoprotein E2


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Informations

  • Détails : 1 vol. (127 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 101-120

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  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Orsay, Essonne). Service Commun de la Documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 0g ORSAY(1988)82
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH2014-034930
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