Pierre Peyret
Pierre Peyret a dirigé les 9 thèses suivantes :
Etude de l'impact de contaminats chimiques alimentaires sur le microbiote intestinal humain.
par Clemence Defois sous la direction de Pierre Peyret - Clermont Auvergne
Sciences de la vie et de la sante
Soutenue le 08-12-2017
Capture de gènes par hybridation couplée au séquençage de nouvelle génération pour l'exploration d'échantillons métagénomiques. : Génomique et écologie microbienne
par Cyrielle Gasc sous la direction de Pierre Peyret - Clermont-Ferrand 1
Sciences de la vie et de la sante
Soutenue le 28-10-2016
Evolution structurale et fonctionnelle des communautés microbiennes digestives sous l'influence de facteurs biotiques et abiotiques. Développement d'une biopuce ADN ciblant les gènes impliqués dans la dégradation des glucides complexes alimentaires
par Sophie Comtet-Marre sous la direction de Évelyne Forano et de Pierre Peyret . - Clermont-Ferrand 2
Génomique et Ecologie Microbienne
Soutenue le 26-06-2014
Conception et analyse des biopuces à ADN en environnements parallèles et distribués
par Faouzi Jaziri sous la direction de David R. C. Hill et de Pierre Peyret . - Clermont-Ferrand 2
Informatique
Soutenue le 23-06-2014
Détermination de sondes oligonucléotidiques pour outils moléculaires à haut débit : application pour le développement d'une nouvelle approche de capture de gènes pour l'écologie microbienne
par Jérémie Denonfoux sous la direction de Pierre Peyret - Clermont-Ferrand 2
Génomique et Ecologie Microbienne
Soutenue le 09-01-2013
Caractérisation des voies métaboliques d'une souche de Streptomyces impliquée dans la production de vanilline
par Jérôme Brunelliere sous la direction de Pierre Peyret - Clermont-Ferrand 2
Physiologie et génétique moléculaire
Soutenue en 2009
Caractérisation des communautés procaryotiques impliquées dans la bioremédiation d'un sol pollué par des hydrocarbures et développement d'outils d'analyse à haut débit : les biopuces ADN
par Cécile Militon sous la direction de Pierre Peyret - Clermont-Ferrand 2
Génomique et écologie microbienne
Soutenue en 2007
Evolution des génomes microsporidiens et mécanisme d'adaptation moléculaire chez les parasites intracellulaires obligatoires
par Abdel Belkorchia sous la direction de Pierre Peyret - Clermont-Ferrand 2
Microbiologie
Soutenue en 2007
Méthodes et outils logiciels pour la conception de sondes oligonucléotidiques pour puces à ADN
par Sébastien Rimour sous la direction de Pierre Peyret et de David Hill . - Clermont-Ferrand 2
Informatique
Soutenue en 2006
Pierre Peyret a été président de jury des 2 thèses suivantes :
Développement et premières applications d'une méthode de tri de cellules bactériennes par marquage de l'ADN avec des nanoparticules magnétiques pour l'étude de la diversité bactérienne environnementale et des transferts horizontaux de gènes in situ
par Jérémy Pivetal sous la direction de Pascal Simonet , Naoufel Haddour et de Marie Frenea-Robin . - Ecully, Ecole centrale de Lyon
Ingéniérie pour le vivant
Soutenue le 03-05-2013
Caractérisation de facteurs bactériens essentiels à la virulence des souches de Escherichia coli associées à la maladie de Crohn
par Benoit Chassaing sous la direction de Arlette Darfeuille-Michaud - Clermont-Ferrand 1
Microbiologie
Soutenue le 09-12-2011
Pierre Peyret a été rapporteur des 9 thèses suivantes :
Taxonomie et inférence fonctionnelle des procaryotes : développement de MACADAM, une base de données de voies métaboliques associées à une taxonomie
par Malo Le Boulch sous la direction de Géraldine Pascal et de Sylvie Combes . - Toulouse, INPT
Pathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition
Soutenue le 20-12-2019
Deciphering the interactions between plants and bacteria in the context of isoprenoid biosynthesis in Arabidopsis thaliana
par Chloé Groh sous la direction de Florence Arsène-Ploetze et de Dimitri Heintz . - Strasbourg
Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Soutenue le 15-10-2019
Interrelations entre la structure des aliments, les protéines alimentaires et le microbiote intestinal abordées par des approches haut-débit et de microbiologie.
par Daphné Jaoui sous la direction de Marion Leclerc - Université Paris-Saclay (ComUE)
Sciences de la vie et de la santé
Soutenue le 08-09-2017
Nouvelle approche de décryptage de la diversité bactérienne environnementale par capture magnétique de populations spécifiques de bactéries au sein de microbiotes complexes
par David Royet sous la direction de Pascal Simonet et de Marie Frenea-Robin . - Lyon
Ingénierie pour le vivant
Soutenue le 16-03-2017
Diagénèse de l’ADN bactérien et analyses métagénomiques de pathologies bactériennes du passé
par Olivier Gorgé sous la direction de Eva-Maria Geigl - Université Paris-Saclay (ComUE)
Sciences de la vie et de la santé
Soutenue le 13-12-2016
Mécanismes adaptatifs et interactions métaboliques au sein de communautés microbiennes soumises au stress arsénié
par Jérémy Andres sous la direction de Philippe Bertin - Strasbourg
Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Soutenue le 15-10-2014
Etude du rôle des microorganismes dans les modifications biochimiques intervenant lors de la maturation des coagulums de latex d’Hevea brasiliensis : impact sur les propriétés du caoutchouc naturel sec.
par Mélanie Salomez sous la direction de Eric Dubreucq - Montpellier, SupAgro
Biotechnologie, microbiologie
Soutenue le 03-02-2014
Étude des communautés microbiennes (bactéries, archaea et eucaryotes) et de leurs variations spatiotemporelles dans la mine de Carnoulès fortement contaminée en arsenic
par Aurélie Volant sous la direction de Françoise Elbaz et de Philippe Bertin . - Montpellier 2
Eaux Continentales et Société
Soutenue le 12-12-2012
Diversité bactérienne des sols : accès aux populations à effectifs minoritaires "the rare biosphere"
par Aurélie Faugier sous la direction de Pascal Simonet - Ecully, Ecole centrale de Lyon
Microbiologie
Soutenue le 12-03-2010
Pierre Peyret a été membre de jury des 5 thèses suivantes :
Etude fonctionnelle des systèmes pectinolytiques et xylanolytiques de Bacteroides xylanisolvens, espèce bactérienne majeure du côlon de l'homme
par Jordane Despres sous la direction de Pascale Mosoni - Clermont-Ferrand 2
Nutrition et Science des Aliments
Soutenue le 09-11-2015
Détermination de sondes oligonucléotidiques pour l'exploration à haut débit de la diversité taxonomique et fonctionnelle d'environnements complexes
par Nicolas Parisot sous la direction de Eric Peyretaillade - Clermont-Ferrand 2
Bioinformatique et Ecologie Microbienne
Soutenue le 17-10-2014
Caractérisation des capacités métaboliques des populations microbiennes impliquées dans les processus de bioremédiation des chloroéthènes par des approches moléculaires haut débit : les biopuces ADN fonctionnelles
par Eric Dugat-Bony sous la direction de Corinne Petit-Biderre - Clermont-Ferrand 2
Génomique et Ecologie Microbienne
Soutenue le 07-11-2011
Structure et activité de la communauté des Archaea méthanogènes du rumen en relation avec la production de méthane par les ruminants
par Milka Popova sous la direction de Diego Pablo Morgavi - Clermont-Ferrand 2
Nutrition et Science des Aliments
Soutenue le 12-04-2011
Nouveau design de sondes pour biopuces ADN fonctionnelles et caractérisation des capacités de biodégradation des communautés bactériennes de sols pollués par des hydrocarbures
par Sébastien Terrat sous la direction de Eric Peyretaillade - Clermont-Ferrand 2
Génomique et écologie microbienne
Soutenue le 15-10-2010
