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Christophe Ambroise a rédigé la thèse suivante :

Approche probabiliste en classification automatique et contraintes de voisinage

par Christophe Ambroise sous la direction de Gérard Govaert - Compiègne

Contrôle des systèmes

Soutenue en 1996

Christophe Ambroise dirige actuellement les 3 thèses suivantes :

Intégration de données biologiques hétérogènes par inférence de modèle graphique mixte

par Do Sanou sous la direction de Christophe Ambroise - université Paris-Saclay

Mathématiques aux interfaces

En préparation depuis le 01-10-2019

Amélioration de la précision de prédiction pan-génomique du phénotype par une approche de biologie des systèmes

par Abdou rahmane Wade sous la direction de Leopoldo Sanchez rodriguez , Vincent Segura et de Christophe Ambroise . - Paris, Institut agronomique, vétérinaire et forestier de France

Sciences agronomiques

En préparation depuis le 05-02-2019

Prise en compte de l’organisation hiérarchique des espèces pour la découverte de signatures métagénomiques multi-échelles.

par Antoine Bichat sous la direction de Christophe Ambroise et de Mahendra Mariadassou . - université Paris-Saclay

Mathématiques appliquées

Soutenue le 09-12-2020

Christophe Ambroise a dirigé les 9 thèses suivantes :

Network inference from incomplete abundance data

par Raphaëlle Momal sous la direction de Stéphane Robin et de Christophe Ambroise . - université Paris-Saclay

Mathématiques appliquées

Soutenue le 12-11-2020

Statistical learning for omics association and interaction studies based on blockwise feature compression

par Florent Guinot sous la direction de Christophe Ambroise - Université Paris-Saclay (ComUE)

Sciences de la vie et de la santé

Soutenue le 04-12-2018

Statistical approaches to detect epistasis in genome wide association studies

par Virginie Stanislas sous la direction de Christophe Ambroise et de Cyril Dalmasso . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Sciences de la vie et de la santé

Soutenue le 18-12-2017

Contrôle des fausses découvertes lors de la sélection de variables en grande dimension

par Jean-Michel Bécu sous la direction de Christophe Ambroise et de Yves Grandvalet . - Compiègne

Technologies de l’Information et des Systèmes

Soutenue le 10-03-2016

Spatial clustering of linkage disequilibrium blocks for genome-wide association studies

par Alia Dehman sous la direction de Christophe Ambroise et de Pierre Neuvial . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Sciences de la vie et de la santé

Soutenue le 09-12-2015

Inférence de réseaux de régulation génétique à partir de données du transcriptome non indépendamment et indentiquement distribuées

par Camille Charbonnier sous la direction de Christophe Ambroise et de Julien Chiquet . - Evry-Val d'Essonne

Mathématiques appliquées

Soutenue le 04-12-2012

Statistical methods to account for different sources of bias in Genome-Wide association studies

par Matthieu Bouaziz sous la direction de Christophe Ambroise et de Mickaël Guedj . - Evry-Val d'Essonne

Mathématiques appliquées

Soutenue le 22-11-2012

Statistical methods for robust analysis of transcriptome data by integration of biological prior knowledge

par Marine Jeanmougin sous la direction de Christophe Ambroise et de Mickaël Guedj . - Evry-Val d'Essonne

Mathématiques appliquées

Soutenue le 16-11-2012

Approches modèles pour la structuration du web vu comme un graphe

par Hugo Zanghi sous la direction de Christophe Ambroise - Evry-Val d'Essonne

Mathématiques appliquées

Soutenue le 25-06-2010

Christophe Ambroise a été président de jury des 6 thèses suivantes :

Etude de la composante génétique de la Polyarthrite Rhumatoïde par séquençage d'exomes : contribution des variants rares

par Maëva Veyssiere sous la direction de Elisabeth Petit-Teixeira et de Valérie Chaudru . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Sciences de la vie et de la santé

Soutenue le 23-10-2019

Inférence de réseaux causaux à partir de données interventionnelles

par Gilles Monneret sous la direction de Grégory Nuel , Florence Jaffrézic et de Andrea Rau . - Sorbonne université

Mathématiques appliquées

Soutenue le 15-02-2018

Expression tissulaire des gènes paralogues : application au cerveau humain et à son état pathologique

par Solène Julien sous la direction de Vincent Frouin - Université Paris-Saclay (ComUE)

Imagerie et physique médicale

Soutenue le 19-12-2017

Contributions a l’analyse de données multivoie : algorithmes et applications

par Olga Lechuga lopez sous la direction de Arthur Tenenhaus et de Laurent Le Brusquet . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Mathématiques et Informatique

Soutenue le 03-07-2017

Modélisation de la composante génétique des maladies humaines : Données familiales et Modèles Mixtes

par Claire Dandine-Roulland sous la direction de Philippe Broët - Université Paris-Saclay (ComUE)

Santé publique - génétique statistique

Soutenue le 04-10-2016

Regulatory networks driving bladder cancer

par Rémy Nicolle sous la direction de Mohamed Elati et de François Radvanyi . - Evry-Val d'Essonne

Biologie cellulaire et moléculaire

Soutenue le 09-01-2015

Christophe Ambroise a été rapporteur des 10 thèses suivantes :

Modélisation dynamique, classification et détection de changement dans les panels catégoriels issus d'un réseau d'eau intelligent

par Milad Leyli Abadi sous la direction de Allou Badara Samé et de Latifa Oukhellou . - Paris Est

Informatique

Soutenue le 12-12-2019

Méthodes d'apprentissage statistique pour le criblage virtuel de médicament

par Benoit Playe sous la direction de Véronique Stoven - Paris Sciences et Lettres (ComUE)

Bio-informatique

Soutenue le 02-07-2019

Contributions à la génétique et l'épidémiologie des maladies complexes pour une médecine personnalisée

par Félix Balazard sous la direction de Gérard Biau et de Pierre-François Bougnères . - Sorbonne université

Mathématiques

Soutenue le 17-12-2018

Unsupervised deconvolution of bulk omics profiles : methodology and application to characterize the immune landscape in tumors

par Urszula Czerwińska sous la direction de Andrei Zinovyev et de Vassili Soumelis . - Sorbonne Paris Cité

Interdisciplinaire

Soutenue le 02-10-2018

Méthodes de factorisation matricielle pour la génomique des populations et les tests d'association

par Kévin Caye sous la direction de Olivier François et de Olivier Michel . - Université Grenoble Alpes (ComUE)

MBS - Modèles, méthodes et algorithmes en biologie, santé et environnement

Soutenue le 11-12-2017

Analyse intégrative de données génomiques et pharmacologiques pour une meilleure prédiction de la réponse aux médicaments anti-cancer

par Yu Fu sous la direction de Fabrice André et de Céline Lefebvre . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Soutenue le 19-12-2016

Von Mises-Fisher based (co-)clustering for high-dimensional sparse data : application to text and collaborative filtering data

par Aghiles Salah sous la direction de Mohamed Nadif - Sorbonne Paris Cité

Science de données

Soutenue le 21-11-2016

Analyse génomique de la coinfection par le virus VIH et VHC

par Damien Ulveling sous la direction de Jean-François Zagury - Paris, CNAM

Bioinformatique

Soutenue le 28-06-2016

Classification et inférence de réseaux pour les données RNA-seq

par Mélina Gallopin sous la direction de Gilles Celeux et de Florence Jaffrézic . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Mathématiques aux interfaces

Soutenue le 09-12-2015

Statistiques bayésiennes en génétique des populations : modèle à facteurs et processus gaussiens pour étudier la variation génétique neutre et adaptative

par Nicolas Duforet-Frebourg sous la direction de Michaël Blum - Grenoble

Modèles, méthodes et algorithmes en biologie, santé et environnement

Soutenue le 02-10-2014

Christophe Ambroise a été membre de jury des 4 thèses suivantes :

A statistical and computational framework for multiblock and multiway data analysis

par Arnaud Gloaguen sous la direction de Arthur Tenenhaus - université Paris-Saclay

Traitement du signal et des images

Soutenue le 23-09-2020

Développement de méthodes statistiques pour l'identification de gènes d'intérêt en présence d'apparentement et de dominance, application à la génétique du maïs

par Fabien Laporte sous la direction de Tristan Mary-Huard - Université Paris-Saclay (ComUE)

Mathématiques appliquées

Soutenue le 13-03-2018

Heritability Estimation in High-dimensional Mixed Models : Theory and Applications.

par Anna Bonnet sous la direction de Elisabeth Gassiat et de Céline Lévy-Leduc . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Mathématiques appliquées

Soutenue le 05-12-2016

Analyse génomique en médecine de précision : Optimisations et outils de visualisation

par Frederic Commo sous la direction de Fabrice André - Université Paris-Saclay (ComUE)

Recherche clinique, innovation technologique, santé publique

Soutenue le 24-11-2015