Marc Javoy a dirigé les 13 thèses suivantes :

Géochimie fondamentale et appliquée
Soutenue en 2004
Thèse soutenue

Géochimie fondamentale et appliquée
Soutenue en 1997
Thèse soutenue

Terre, océan, espace
Soutenue en 1990
Thèse soutenue

Terre, océan, espace
Soutenue en 1989
Thèse soutenue